血清成分復雜，雖含許多對細胞有利成分，也含有對細胞有害的成分。
使血清有幾個明顯的缺點：
【一】對大多數(shù)細胞，在體內狀態(tài)，血清不是它們接觸的生理學液體，只是在損傷愈合以及血液凝固過程中才接觸血清，因此使用血清有可能改變某種細胞在體內的正常狀態(tài)，血清可能促進某些細胞的生長（成纖維細胞）同時抑制另一類細胞生長（表皮細胞）。
【二】取材中可能帶入支原體、病毒，對細胞產(chǎn)生潛在影響，可能導致實驗失敗或實驗結果不可靠性。
【三】血清含一些對細胞產(chǎn)生毒性的物質，如多胺氧化酶，能與來自高度繁殖細胞的多胺反應（如精胺、亞精胺）形成有細胞毒性作用的聚精胺。補體、抗體、細菌毒素等都會影響細胞生長，甚至造成細胞死亡。
【四】 動物個體不同，血清產(chǎn)地、批號不同，每批質量差異甚大，其成分不能保持一致。
【五】血清的使用使得實驗和生產(chǎn)的標準化困難，其中的蛋白質使得某些轉基因蛋白生物藥品生產(chǎn)中分離純化工作很難完成。
【六】大規(guī)模生產(chǎn)中，血清來源越來越困難，價格昂貴，是構成動物細胞培養(yǎng)對生產(chǎn)成本的主要部分之一。
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